旁插扁袋除尘器由若干个独立的仓室组成，采用平板形（信封形）滤袋，从箱体侧面插入安装。
旁插扁袋除尘器在负压状态下工作，含尘气体由位于箱体上部的进气管经气流分布冈进入袋滤室。含尘气体由外向内通过滤袋，粉尘被阻留在滤袋的外表面，净化后的气体由滤袋内部进入洁净室，然后通过反吹风控制阀进入下部排气总管，好终经风机排出。
某室清灰时，该室的净气出口阀关闭，反吹阀同时开启，借助箱体的负压使环境空气通过反吹阀进入滤袋内，使滤袋膨胀，然后阀板复位，滤袋又处于过滤状态。如此往复动作数次，附着在滤袋外表面的粉尘被抖落，落入灰斗内，达到清灰的目的。反吹气流携同部分未落人灰斗的粉尘，进入相邻的袋滤室再次过滤。
清灰逐室进行。各仓室的阀门切换有三种基本形式：
1)电动凸轮拨动切换；
2)电动链轮拨动切换；
3)电动缸直接推动切换。
旁插扁袋除尘器具有以下特点：
1)由于采用扁袋旁插安装，因此在相同箱体容积内，比圆形滤袋可布置更多的过滤面积，占地面积少；
2)由于采用相同的过滤单元结构，可以根据不同处理风量的需要，组成单层、双层乃至多层不同规格的组合型式，便于设计选择及运输安装；
3)采用上进风、下排风方式，含尘气体自上而下流动，有利于粉尘沉降；
4)更换滤袋可在滤袋室外进行，改善了劳动条件，减少了换袋人员接触粉尘的危害。从侧面装、卸滤袋可降低所需的厂房高度，但由于检查门过多，因此要求设备具有良好的密闭性；
5)滤袋之间距离过小，清灰时滤袋膨胀导致相互贴近，影响粉尘的沉降，从而削弱清灰效果。